https://bodybydarwin.com
Slider Image

עץ החיים השבר האינטראקטיבי מתקרב להיסטוריה האבולוציונית של כל כדור הארץ

2022

מפרוטוזואנים לאנשים יש המון חיים בכוכב הלכת הזה, והכול קשור לאב קדמון משותף ממנו הכל יורד. קשה לדמיין, קל וחומר לדמיין את כל המשותף והמורשת המשותפת של כל אותם החיים. אבל עכשיו אתה יכול לעשות את זה עם פרקטלים.

אתר חדש שהושק היום מאפשר לחקור את כל עץ החיים האבולוציוני, להתקרב ולהתרחק כמו שהיית משתמש במפה מקוונת. קוראים לזה OneZoom והיא בנויה על תבנית פרקטלית שחוזרת על אותה צורת הסתעפות, לא משנה עד כמה התרחבה או כווצה את השקפתך. ג'יימס רוזינדל, פרופסור במחלקה למדעי החיים באימפריאל קולג 'בלונדון, הגה את הרעיון ותכנת את OneZoom בשיתוף פעולה עם לוק הרמון, ביולוג מאוניברסיטת איידהו.

הפרויקט היה מעט תאונה משמחת, אמר רוזינדל בראיון. הביולוג האבולוציוני היה מרותק לפרקטלים, רצה להשתמש בממשק התקרבות פרקטלי כדי להציג מערכי נתונים גדולים ומורכבים, אך נדרש שיתוף פעולה עם הרמון כדי להחליט על עץ החיים כנשאו.

עץ הוא מטאפורה ראויה להיסטוריה של החיים (בין הרבה דברים אחרים) מכיוון שהוא מתחיל בהתחלה מוגדרת בבירור, ומציע גם ציר זמן וגם חופה עצומה של מידע מחובר זה לזה. בעץ חיים, תא המטען מייצג בדרך כלל את החיים הראשונים בכדור הארץ, ואז הוא מתפצל לארונות וענפים עבור ממלכות שונות, כמו צמחים ובעלי חיים. אלה מתפצלים לענפים קטנים יותר, אומרים לגבי דגים, יונקים, ציפורים וכן הלאה; ואלה מתפרקים לזרדים קטנים וקטנים יותר, המייצגים משפחות וקבוצות, ולבסוף עלים המייצגים מינים. אבל נסה לשים את כל המידע הזה על עץ בודד, וזה בלתי אפשרי, אמר רוזינדל. זה לא יתאים לדף אחד, לא דף שמקורו בצמח ולא דף דיגיטלי.

רוזינדל אמר כי הדבר מונע ממדענים והציבור להעריך באופן מלא את הקשר הפילוגנטי בין מיליוני מינים שונים. בעוד שמדענים אחרים ומומחים להמחשת נתונים הראו קשרים בין עץ החיים באמצעות צורות אחרות, כמו טבעות קונצנטריות, רוזינדל מאמין שעץ ניתן להגדלה הוא ממשק הרגשה נוח יותר. לדבריו, הוא קיבל השראה בחלקו ממפות גוגל, שמציעה תצוגה ניתנת להגדלה וניתנת להגדלה עם פירוט רב או מעט ככל שמשתמש רוצה לראות.

"השקפה פרקטלית כבר מיושמת, הוא אמר." לא משנה כמה רחוק אתה הולך, אתה מקבל יותר ויותר מידע. מה שהייתי רוצה לעשות זה לבנות את Google Earth לביולוגיה. "

בתחילת דרכו, OneZoom נראה כמו עץ, עם גזע, ענפים, זרדים ועלים צבעוניים. התקרב לסניפים הראשונים, ותתחיל לראות פרטים נוספים. לפני בערך 166 מיליון שנה, למשל, אתה רואה שמונוטרמות התפתחו, ואחריהן נקבים ויונקים שליה. העץ מתפתל לעבר העתיד, כאשר יותר ויותר ענפים מייצגים יותר ויותר פרט. הקישורים בין מינים משמשים כמו כבישים במפה, ומראים קשרים ברורים. ברמת העלים תוכלו לדעת אילו מינים מאוימים על ידי הכחדה - המיוצגים עלים אדומים וירוקים - יחד עם קישורים למידע נוסף. בסופו של דבר, רוזינדל יוסיף גם תמונות.

אין גבול למטא-נתונים שבהם היא יכולה להתמודד, ואפילו ניתן להציג אותו בצורות פרקטליות שונות, מספירלה של ג'וליה ועד עץ נוצה.

הנתונים מגיעים מפרויקט עץ החיים הפתוח, שיתוף פעולה בין ביולוגים ומדענים אחרים ברחבי העולם. זה מכיל עבודה בשווי עשרות שנים בפילוגניה, היסטוריה אבולוציונית וקשרים בין קבוצות של אורגניזמים. הפרויקט נמצא כשנה מעץ שלם מכל החיים, אמר רוזינדל. הוא רצה שתהיה מערכת שתוכל לדמיין אותה ברגע שהיא מוכנה.

נכון לעכשיו, OneZoom מכיל רק יונקים, אך עדיין מדובר ביותר מ- 5, 000 מינים, כולם מתואמים זה עם זה ומקודדים צבע לפי רמות האיום שלהם. לרוזינדל יש תוכניות גדולות להמשך, והוא אפילו רוצה לבנות אפליקציה לחיפוש לסמארטפונים, המציגה את ההיסטוריה והיחסים בין כל החיים על כדור הארץ.

"מה שהייתי רוצה לעשות זה לדמיין מידע על כל מין, מידע על כל קשר, עם צורות הביניים שלהם, מאובנים וכל המידע המופלא שקיים על תולדות החיים על כדור הארץ במקום אחד שהוא אמר.

OneZoom אמור היה לצאת לדרך בשעה 17:00 שעון מזרח היום - בדוק את זה
כאן. מאמר המתאר את שיטותיו של רוזינדל והרמון יפורסם בסדרת "כלים מגניבים" של כתב העת הגישה הפתוחה PLOS Biology.

האלמוגים צומחים בדפוסים, גם אם לא נוכל לראות אותם תמיד

האלמוגים צומחים בדפוסים, גם אם לא נוכל לראות אותם תמיד

עריכת גנים יכולה לסייע בחיסול ה- HIV

עריכת גנים יכולה לסייע בחיסול ה- HIV

מדענים מדברים נגד 'האלימות' הנדרשת לבניית הטלסקופ החדש הזה

מדענים מדברים נגד 'האלימות' הנדרשת לבניית הטלסקופ החדש הזה